Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRLP54845 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRLP54845 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRLP54845 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRLP54845 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRLP54845 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRLP54845 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRLP54845 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NRLP54845 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRLP54845 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRLP54845 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRLP54845 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRLP54845 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRLP54845 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRLP54845 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRLP54845 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRLP54845 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRLP54845 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRLP54845 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRLP54845 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NRLP54845 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRLP54845 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRLP54845 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRLP54845 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NRLP54845 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NRLP54845 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRLP54845 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRLP54845 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRLP54845 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRLP54845 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms