Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAG1P54619 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKAG1P54619 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAG1P54619 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms