Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRAP54198 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRAP54198 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRAP54198 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRAP54198 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRAP54198 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRAP54198 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRAP54198 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRAP54198 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRAP54198 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIRAP54198 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRAP54198 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIRAP54198 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRAP54198 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRAP54198 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRAP54198 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIRAP54198 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRAP54198 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRAP54198 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRAP54198 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRAP54198 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIRAP54198 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRAP54198 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRAP54198 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIRAP54198 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRAP54198 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HIRAP54198 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HIRAP54198 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRAP54198 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRAP54198 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRAP54198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRAP54198 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRAP54198 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HIRAP54198 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRAP54198 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRAP54198 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRAP54198 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRAP54198 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRAP54198 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIRAP54198 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRAP54198 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRAP54198 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRAP54198 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRAP54198 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRAP54198 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRAP54198 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRAP54198 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRAP54198 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRAP54198 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRAP54198 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRAP54198 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRAP54198 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRAP54198 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRAP54198 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRAP54198 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRAP54198 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRAP54198 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRAP54198 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRAP54198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRAP54198 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRAP54198 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRAP54198 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRAP54198 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRAP54198 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRAP54198 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRAP54198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRAP54198 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRAP54198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRAP54198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRAP54198 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRAP54198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRAP54198 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRAP54198 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRAP54198 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRAP54198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRAP54198 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRAP54198 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRAP54198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIRAP54198 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRAP54198 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRAP54198 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRAP54198 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRAP54198 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRAP54198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRAP54198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRAP54198 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRAP54198 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms