Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIMK2P53671 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms