Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF143P52747 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF143P52747 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF143P52747 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms