Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA3P51805 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA3P51805 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXNA3P51805 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms