Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN6P51797 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN6P51797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLCN6P51797 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCN6P51797 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms