Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR5P51681 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR5P51681 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR5P51681 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR5P51681 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR5P51681 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR5P51681 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR5P51681 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR5P51681 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR5P51681 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR5P51681 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR5P51681 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR5P51681 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR5P51681 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR5P51681 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR5P51681 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR5P51681 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR5P51681 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR5P51681 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR5P51681 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR5P51681 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR5P51681 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR5P51681 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR5P51681 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR5P51681 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR5P51681 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR5P51681 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR5P51681 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR5P51681 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR5P51681 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR5P51681 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR5P51681 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR5P51681 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR5P51681 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR5P51681 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR5P51681 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR5P51681 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR5P51681 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR5P51681 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR5P51681 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR5P51681 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR5P51681 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR5P51681 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR5P51681 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR5P51681 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR5P51681 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR5P51681 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms