Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A2P50993 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A2P50993 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A2P50993 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms