Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLCSP50747 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLCSP50747 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLCSP50747 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLCSP50747 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLCSP50747 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLCSP50747 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLCSP50747 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLCSP50747 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLCSP50747 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLCSP50747 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLCSP50747 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLCSP50747 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLCSP50747 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLCSP50747 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLCSP50747 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLCSP50747 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLCSP50747 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLCSP50747 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLCSP50747 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLCSP50747 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLCSP50747 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLCSP50747 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLCSP50747 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLCSP50747 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLCSP50747 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLCSP50747 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLCSP50747 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLCSP50747 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLCSP50747 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLCSP50747 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLCSP50747 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLCSP50747 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLCSP50747 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLCSP50747 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLCSP50747 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLCSP50747 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLCSP50747 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLCSP50747 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLCSP50747 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLCSP50747 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLCSP50747 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLCSP50747 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLCSP50747 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLCSP50747 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLCSP50747 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLCSP50747 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLCSP50747 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLCSP50747 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLCSP50747 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLCSP50747 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLCSP50747 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HLCSP50747 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms