Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARRES1P49788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RARRES1P49788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RARRES1P49788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms