Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB3P49720 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB3P49720 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms