Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT3P49368 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT3P49368 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT3P49368 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT3P49368 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT3P49368 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT3P49368 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT3P49368 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT3P49368 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT3P49368 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT3P49368 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT3P49368 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCT3P49368 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT3P49368 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT3P49368 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT3P49368 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCT3P49368 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT3P49368 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT3P49368 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT3P49368 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT3P49368 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCT3P49368 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT3P49368 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT3P49368 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCT3P49368 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCT3P49368 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT3P49368 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT3P49368 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT3P49368 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT3P49368 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCT3P49368 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCT3P49368 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT3P49368 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT3P49368 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT3P49368 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT3P49368 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT3P49368 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT3P49368 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT3P49368 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCT3P49368 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms