Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC11A1P49279 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC11A1P49279 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms