Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA4P43681 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA4P43681 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms