Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGEA1P43355 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAGEA1P43355 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAGEA1P43355 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms