Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A1P43005 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A1P43005 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms