Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA4P41247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PNPLA4P41247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNPLA4P41247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA4P41247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms