Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX19P40855 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX19P40855 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX19P40855 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX19P40855 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX19P40855 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX19P40855 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX19P40855 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX19P40855 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX19P40855 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX19P40855 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX19P40855 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX19P40855 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX19P40855 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX19P40855 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX19P40855 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX19P40855 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX19P40855 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX19P40855 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX19P40855 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX19P40855 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX19P40855 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX19P40855 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX19P40855 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX19P40855 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX19P40855 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms