Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPGP40121 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPGP40121 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPGP40121 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPGP40121 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPGP40121 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPGP40121 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPGP40121 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPGP40121 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPGP40121 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPGP40121 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPGP40121 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPGP40121 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPGP40121 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPGP40121 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPGP40121 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPGP40121 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPGP40121 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPGP40121 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPGP40121 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPGP40121 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPGP40121 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPGP40121 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPGP40121 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPGP40121 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPGP40121 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPGP40121 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPGP40121 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPGP40121 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPGP40121 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPGP40121 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPGP40121 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPGP40121 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPGP40121 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPGP40121 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms