Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP62P37198 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP62P37198 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP62P37198 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP62P37198 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP62P37198 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP62P37198 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP62P37198 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP62P37198 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP62P37198 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP62P37198 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP62P37198 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP62P37198 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP62P37198 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP62P37198 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP62P37198 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP62P37198 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP62P37198 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP62P37198 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP62P37198 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP62P37198 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP62P37198 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP62P37198 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP62P37198 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP62P37198 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP62P37198 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms