Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREBF1P36956 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SREBF1P36956 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SREBF1P36956 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms