Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2IP36954 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2IP36954 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms