Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6V1E1P36543 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1E1P36543 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms