Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDIT3P35638 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDIT3P35638 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms