Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT9P35527 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT9P35527 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT9P35527 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT9P35527 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT9P35527 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT9P35527 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT9P35527 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT9P35527 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT9P35527 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT9P35527 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT9P35527 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT9P35527 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT9P35527 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT9P35527 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT9P35527 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT9P35527 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT9P35527 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT9P35527 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT9P35527 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT9P35527 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT9P35527 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT9P35527 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT9P35527 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT9P35527 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT9P35527 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT9P35527 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT9P35527 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT9P35527 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT9P35527 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT9P35527 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT9P35527 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT9P35527 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT9P35527 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT9P35527 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT9P35527 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT9P35527 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT9P35527 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT9P35527 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT9P35527 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT9P35527 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT9P35527 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT9P35527 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT9P35527 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT9P35527 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT9P35527 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT9P35527 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT9P35527 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT9P35527 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT9P35527 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT9P35527 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT9P35527 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT9P35527 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT9P35527 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT9P35527 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT9P35527 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT9P35527 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT9P35527 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT9P35527 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT9P35527 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT9P35527 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT9P35527 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT9P35527 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT9P35527 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT9P35527 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT9P35527 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT9P35527 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT9P35527 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT9P35527 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT9P35527 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms