Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF2P35227 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF2P35227 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF2P35227 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234 ms