Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCR5P32302 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms