Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1CAMP32004 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
L1CAMP32004 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1CAMP32004 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms