Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCND3P30281 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCND3P30281 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND3P30281 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND3P30281 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND3P30281 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND3P30281 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND3P30281 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND3P30281 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND3P30281 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND3P30281 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND3P30281 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND3P30281 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCND3P30281 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND3P30281 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND3P30281 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND3P30281 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND3P30281 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND3P30281 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND3P30281 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND3P30281 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND3P30281 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND3P30281 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND3P30281 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND3P30281 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCND3P30281 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND3P30281 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND3P30281 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCND3P30281 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND3P30281 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND3P30281 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND3P30281 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND3P30281 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND3P30281 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND3P30281 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND3P30281 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND3P30281 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND3P30281 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND3P30281 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND3P30281 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND3P30281 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND3P30281 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND3P30281 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCND3P30281 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND3P30281 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND3P30281 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND3P30281 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCND3P30281 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND3P30281 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND3P30281 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND3P30281 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND3P30281 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND3P30281 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND3P30281 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCND3P30281 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCND3P30281 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND3P30281 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCND3P30281 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCND3P30281 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCND3P30281 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCND3P30281 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCND3P30281 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCND3P30281 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCND3P30281 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms