Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCSK6P29122 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK6P29122 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms