Protein–RNA interactions for Protein: P27986

PIK3R1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R1P27986 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3R1P27986 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3R1P27986 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3R1P27986 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms