Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTX3P26022 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTX3P26022 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTX3P26022 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTX3P26022 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTX3P26022 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTX3P26022 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTX3P26022 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTX3P26022 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTX3P26022 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTX3P26022 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTX3P26022 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTX3P26022 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTX3P26022 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTX3P26022 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTX3P26022 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTX3P26022 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTX3P26022 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTX3P26022 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTX3P26022 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTX3P26022 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTX3P26022 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTX3P26022 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTX3P26022 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTX3P26022 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTX3P26022 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTX3P26022 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTX3P26022 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTX3P26022 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTX3P26022 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTX3P26022 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTX3P26022 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTX3P26022 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTX3P26022 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTX3P26022 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTX3P26022 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTX3P26022 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTX3P26022 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTX3P26022 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTX3P26022 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTX3P26022 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTX3P26022 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms