Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR1P25024 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCR1P25024 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCR1P25024 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms