Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPHA1P21709 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms