Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB5AP20339 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms