Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1BP20333 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF1BP20333 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF1BP20333 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms