Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN2P20062 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN2P20062 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN2P20062 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN2P20062 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN2P20062 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN2P20062 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCN2P20062 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCN2P20062 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN2P20062 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN2P20062 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN2P20062 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN2P20062 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN2P20062 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN2P20062 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN2P20062 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN2P20062 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN2P20062 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN2P20062 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN2P20062 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN2P20062 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN2P20062 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN2P20062 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN2P20062 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN2P20062 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN2P20062 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN2P20062 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN2P20062 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN2P20062 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCN2P20062 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCN2P20062 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCN2P20062 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN2P20062 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN2P20062 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN2P20062 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCN2P20062 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN2P20062 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN2P20062 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCN2P20062 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCN2P20062 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCN2P20062 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCN2P20062 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN2P20062 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN2P20062 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN2P20062 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN2P20062 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCN2P20062 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCN2P20062 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCN2P20062 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCN2P20062 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms