Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCAM1P19320 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VCAM1P19320 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VCAM1P19320 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms