Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC1P18754 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC1P18754 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC1P18754 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC1P18754 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC1P18754 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC1P18754 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC1P18754 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC1P18754 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC1P18754 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC1P18754 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC1P18754 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC1P18754 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC1P18754 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC1P18754 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC1P18754 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC1P18754 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC1P18754 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC1P18754 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC1P18754 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC1P18754 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC1P18754 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC1P18754 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC1P18754 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RCC1P18754 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC1P18754 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC1P18754 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC1P18754 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC1P18754 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC1P18754 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC1P18754 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC1P18754 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC1P18754 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC1P18754 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC1P18754 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC1P18754 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC1P18754 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC1P18754 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCC1P18754 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCC1P18754 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCC1P18754 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCC1P18754 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCC1P18754 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCC1P18754 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCC1P18754 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCC1P18754 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCC1P18754 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCC1P18754 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCC1P18754 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCC1P18754 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCC1P18754 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCC1P18754 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCC1P18754 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RCC1P18754 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCC1P18754 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms