Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB9P17482 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB9P17482 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB9P17482 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms