Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA2P17301 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA2P17301 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA2P17301 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms