Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB3P16520 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB3P16520 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB3P16520 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB3P16520 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB3P16520 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB3P16520 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB3P16520 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB3P16520 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB3P16520 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB3P16520 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB3P16520 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB3P16520 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB3P16520 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB3P16520 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB3P16520 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB3P16520 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB3P16520 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB3P16520 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB3P16520 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB3P16520 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB3P16520 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB3P16520 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB3P16520 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB3P16520 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB3P16520 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNB3P16520 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNB3P16520 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNB3P16520 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNB3P16520 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNB3P16520 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNB3P16520 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNB3P16520 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms