Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB1P14653 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB1P14653 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms