Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL4P13236 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL4P13236 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL4P13236 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL4P13236 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL4P13236 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL4P13236 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL4P13236 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL4P13236 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL4P13236 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL4P13236 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL4P13236 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL4P13236 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL4P13236 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL4P13236 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL4P13236 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL4P13236 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL4P13236 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL4P13236 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL4P13236 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL4P13236 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL4P13236 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL4P13236 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL4P13236 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL4P13236 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL4P13236 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL4P13236 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL4P13236 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL4P13236 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL4P13236 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL4P13236 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL4P13236 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL4P13236 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL4P13236 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL4P13236 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL4P13236 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL4P13236 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL4P13236 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL4P13236 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL4P13236 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL4P13236 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL4P13236 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL4P13236 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL4P13236 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL4P13236 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms