Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I1P13073 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I1P13073 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms