Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL6A2P12110 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL6A2P12110 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms