Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMP1P11279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMP1P11279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms