Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UMPSP11172 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UMPSP11172 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UMPSP11172 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UMPSP11172 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UMPSP11172 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UMPSP11172 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UMPSP11172 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UMPSP11172 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UMPSP11172 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UMPSP11172 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UMPSP11172 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UMPSP11172 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UMPSP11172 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UMPSP11172 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UMPSP11172 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UMPSP11172 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UMPSP11172 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UMPSP11172 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UMPSP11172 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UMPSP11172 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UMPSP11172 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UMPSP11172 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UMPSP11172 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UMPSP11172 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UMPSP11172 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UMPSP11172 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UMPSP11172 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UMPSP11172 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms