Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR2F1P10589 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F1P10589 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms